Ultime développement du Ju 88, il tentait de répondre aux besoins d'avions opérant à haute altitude après l'abandon du programme Ju 288
qui s'était révélé trop ambitieux.
Contrairement à son prédecesseur, il
partait de la cellulle éprouvée du Junkers 88, les dotant de moteurs
turbo-compressés pour obtenir de bonnes performances en altitude.
Le
développement continua jusqu'à la fin de la guerre, même après que la
directive de se concentrer sur les chasseurs soit entrée en vigueur à
l'automne 1944